الخلاصة

هدفت هذه الدراسة إلى تحديد أنواع الفايروسات والفايرودات (Virome) التي تصيب محصول الكوسا في ناحية اليوسفية/ محافظة بغداد باستعمال تقنية (Metatranscriptomics) بالإضافة الى تقييم برنامج للمكافحة المتكاملة ضدها.
أثبتت نتائج التحليل وجود الفايروس (Squash vein yellowing virus ،SqVYV ) خلال تحديد الجينوم الكامل له الذي وجد أنّه الأكثر تواجدا اذ بلغت نسبة تواجده (44.10%). وثق هذا الجينوم الكامل لهذا الفايروس في قاعدة بيانات بنك الجينات بالاسم (Squash vein yellowing virus isolate Baghdad- Iraq/1) تحت الرمز OQ685960.1. أظهرت النتائج وجود العديد من المتجاورات المتداخلة المشابهة للتسلسل المرجعي للجينوم الكامل لفايروس Squash leaf curl virus ) ،SLCV) وبالرغم انّ فايروس SLCV قد شخص سابقاً جزئياً على محصول الكوسا، بينما في دراستنا هذه تمكنا ولأول مرة في العراق من تحديد تسلسل جينومه الكامل الذي يتكون من قطعتين هما DNA-A و DNA-B. وقد تم ايداع الجينوم الكامل لكلتا القطعتين في بنك الجينات NCBI-GenBank باسماء (Squash leaf curl virus isolate Baghdad-1/Iraq segment DNA-A) تحت الرمز (OQ685961.1) و( Squash leaf curl virus isolate Baghdad-1/Iraq segment DNA-B ) تحت الرمز (OQ685962.1). و أشارت النتائج تشخيص القطعتين الأولى والثانية ( DNA- A و DNA-B) الخاصة بجينوم الفايروس( Tomato leaf curl Palampur virus ،ToLCPaLV) والتي تم تسجيلها ضمن قاعدة بيانات بنك الجينات تحت الاسمين (Tomato leaf curl Palampur virus isolate Baghdad-1/Iraq segment DNA-A) و (Tomato leaf curl Palampur virus isolate Baghdad-1/Iraq segment DNA-B) وتحت الرمزين OQ693629.1 و OQ693630.1. أضافة الى ذلك فقد أثبتت النتائج وجود الفايروس (Cucumber vein yellowing virus ،CVYV) من خلال تشخيص وتحديد جينومه الكامل والذي سجل الفايروس في قاعدة بيانات بنك الجينات باسم( Cucumber vein yellowing virus isolate Iraq-1) تحت الرمز OQ685957.1. وبالرغم من وجود العديد من السلالات والعزلات من هذا الفايروس المنتشرة في العديد من دول منطقة الشرق أوسط الاّ إنّه لم يسجل سابقاً في العراق على أي محصول لذا يعد هذا التسجيل هو الأول لهذا الفايروس في العراق. اشارت النتائج أيضا الى وجود القطعتين RNA-1 و RNA-2 الخاصة بالجينوم الفايروس Cucurbit yellow stunting disorder virus) ،CYSDV). والذي كان الأقل تواجدا بين الفايروسات المشخصة في هذه الدراسة بنسب 0.014 و 0.067 % للقطعتين الأولى والثانية. وبناءً على هذه النتائج ، فقد سجل تحت الاسمين Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Iraq-1 segment RNA1) ) و( Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Iraq-1 segment RNA2 )وتحت الرمزين OQ685958.1 و OQ685959.1 على التوالي. جدير بالذكر اننا لم نجد أي من الدراسات السابقة حول هذا الفايروس في العراق او في منطقة الشرق الأوسط ، لذلك يعد هذا التسجيل الأول لهذا الفايروس وجينومه الكامل في العراق. يضاف الى مجموعة الفايروسات التي تم تشخيصها في هذه الدراسة تشخيص الفايرويد (Citrus exocortis viroid ،CEVd) اذ تمّ الحصول على الجينوم الكامل لهذا الفايرويد الذي وثق في قاعدة بيانات بنك الجينات باسم (Citrus exocortis viroid isolate Baghdad-1/Iraq ) تحت الرمز OR343512.1. وبالرغم من تسجيل هذا الفايرويد على محصولي الخس والتين في محافظات صلاح الدين والنجف الاّ أنّه شخص في هذه الدراسة على محصول الكوسا في محافظة بغداد وبهذا يكون هذا التسجيل هو الأول له في العراق على محصول الكوسا.
أكدت نتائج التجربة الحقلية انّ هناك تأثيرمعنوي لمعاملة التكامل بين التركيب الوراثي SAMA و تطبيق المبيدات الحشرية و تطبيق العناصر الغذائية خلال خفض معدل نسبة الإصابة إلى 25% ونسبة شدة الإصابة إلى 20%. مقارنة بالمعاملة المتمثلة بزراعة التركيب الوراثي SAMA بدون أي إضافة والتي كانت فيها نسبة الإصابة وشدتها الأعلى بمقدار 80% و 38% على التوالي. أظهرت النتائج تفوق هذه المعاملة بأعطائهأ أعلى معدل انتاج بلغ 97.05 كغم واقل معدل لكمية الثمار المريضة بلغ 1.55 كغم وبفارق معنوي عن بقية المعاملات.
أثبتت النتائج زيادة معدلات نسبة الإصابة مع انخفاض درجة الحرارة اذ بلغت في القراءة الرابعة 59.37% عندما انخفض معدل درجة الحرارة الى 17.87 مͦ بينما كانت اقل نسبة إصابة في القراءة الأولى بمقدار 18.75% عندما كان معدل درجة الحرارة 25.69 مͦ. اما معدلات شدة الإصابة فقد كانت بنفس العلاقة خصوصاً بعد القراءة الأولى. اشارت النتائج أيضا الى وجود علاقة طردية ضعيفة جدا بين درجة الحرارة و اعداد حشرة الذبابة البيضاء اذ كلما انخفضت درجة الحرارة انخفضت معدلات اعداد الحشرة بحيث عند اقل درجة حرارة التي بلغت 17.87 مº معدل عدد الحشرة 2.88 بينما في درجة الحرارة 24.95مº سجلت اعلى معدلاً لعدد الحشرة الذي بلغ 5.45 ومن جانب آخر وجدت علاقة معنوية طردية بين معدل نسبة الرطوبة ومعدل اعداد حشرة الذبابة البيضاء اذ بلغت في القراءة الأولى نسبة الرطوبة 30.2 ومعدل اعداد الحشرة 1.58 بينما عندما ارتفعت نسبة الرطوبة الى 39.04 كانت معدل اعداد الحشرة 5.45 في القراءة الثانية.
أكدت نتائج تحليل المعلوماتية الحيوية ان التركيب الوراثي SAMA كان مصاباً بالفايروسات الخمسة SLCV)، ToLCPalV، SqVYV ، CVYVو CYSDV ) والفايرويد CEVd بينما التركيب الوراثي ALEXANDER كان مصاب بالفايروس SLCV فقط. وأوضحت نتائج تحليل النسخ المقارن بين جينومي البلاستيدات الخضراء للتركيبين الوراثيين SAMA وALEXANDER انّ نسبة التشابه بينهما كانت 66.7% فقط اذ تبين وجود العديد من المناطق الجينية المختلفة بينهما. وقد تم تاكيد هذه النتيجة، وذلك بتحديد الجينات التي وصل عددها الى 84 جين اختلفت في تعبيرها بمستويات مختلفة بين التركيبين الوراثييين وكان أبرزها 12 جين تعود إلى أربع مجاميع جينية شمل (Photosystem proteins و Ribosomal proteins وCytochrome proteins و Ycf2 protein ) والتي كان تعبيرها الجيني ذا اختلاف عالي المعنوية (0.01 او اقل) سواء ارتفاعاً (درجة ثقة التعبير التفاضلي موجبة) او انخفاضاً (درجة ثقة التعبير التفاضلي موجبة).
إنّ نتائج هذه الدراسة تشير بوضوح الى نجاح تطبيق تقنية NGS في الكشف عن مجموع الفايروسات والفايرودات التي تصيب محصول الكوسا مع ضرورة اجراء المزيد من الدراسات باستعمال نفس التقنية لتشخيص الفايروسات التي تصيب نفس المحصول ومحاصيل أخرى في محافظات أخرى في العراق من اجل اختيار الأساليب الأكثر ملائمة لمقاومتها سوءا كانت بزراعة أصناف او تراكيب وراثية مقاومة وفي حالة عدم توفرها إمكانية تطبيق الأسلوب التكاملي الذي يتضمن استعمال التراكيب الوراثية الأقل حساسية او الأكثر تحملا للإصابة مع عدد من المبيدات الحشرية الجهازية التي تستعمل بشكل متناوب وتطبيق التغذية النباتية الصحيحة.